Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAM2Q15035 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAM2Q15035 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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