Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATXN7L3Q14CW9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATXN7L3Q14CW9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATXN7L3Q14CW9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATXN7L3Q14CW9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATXN7L3Q14CW9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms