Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERV3-1Q14264 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERV3-1Q14264 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERV3-1Q14264 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERV3-1Q14264 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms