Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM53BQ14153 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM53BQ14153 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53BQ14153 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53BQ14153 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.3 ms