Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOFQ13790 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOFQ13790 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOFQ13790 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOFQ13790 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOFQ13790 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOFQ13790 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOFQ13790 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOFQ13790 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOFQ13790 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOFQ13790 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOFQ13790 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOFQ13790 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOFQ13790 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOFQ13790 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOFQ13790 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOFQ13790 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOFQ13790 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOFQ13790 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOFQ13790 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOFQ13790 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOFQ13790 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOFQ13790 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
APOFQ13790 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOFQ13790 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOFQ13790 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOFQ13790 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOFQ13790 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOFQ13790 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOFQ13790 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOFQ13790 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOFQ13790 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOFQ13790 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOFQ13790 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOFQ13790 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOFQ13790 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOFQ13790 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOFQ13790 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOFQ13790 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOFQ13790 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOFQ13790 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOFQ13790 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOFQ13790 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOFQ13790 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOFQ13790 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOFQ13790 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOFQ13790 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOFQ13790 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOFQ13790 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOFQ13790 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOFQ13790 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOFQ13790 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOFQ13790 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOFQ13790 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOFQ13790 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOFQ13790 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOFQ13790 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOFQ13790 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOFQ13790 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOFQ13790 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOFQ13790 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOFQ13790 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOFQ13790 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOFQ13790 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOFQ13790 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOFQ13790 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOFQ13790 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOFQ13790 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOFQ13790 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOFQ13790 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOFQ13790 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOFQ13790 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOFQ13790 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOFQ13790 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOFQ13790 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOFQ13790 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOFQ13790 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOFQ13790 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOFQ13790 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOFQ13790 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOFQ13790 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOFQ13790 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOFQ13790 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOFQ13790 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOFQ13790 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOFQ13790 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOFQ13790 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOFQ13790 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOFQ13790 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOFQ13790 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APOFQ13790 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOFQ13790 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms