Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAPSNQ13702 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAPSNQ13702 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAPSNQ13702 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAPSNQ13702 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAPSNQ13702 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAPSNQ13702 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAPSNQ13702 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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