Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
PKD2Q13563 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PKD2Q13563 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PKD2Q13563 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
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