Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PDE3BQ13370 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PDE3BQ13370 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PDE3BQ13370 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PDE3BQ13370 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDE3BQ13370 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PDE3BQ13370 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDE3BQ13370 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PDE3BQ13370 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PDE3BQ13370 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PDE3BQ13370 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDE3BQ13370 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PDE3BQ13370 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDE3BQ13370 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
PDE3BQ13370 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDE3BQ13370 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PDE3BQ13370 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDE3BQ13370 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDE3BQ13370 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PDE3BQ13370 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PDE3BQ13370 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PDE3BQ13370 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
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