Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
GRIN2BQ13224 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
GRIN2BQ13224 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
GRIN2BQ13224 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
GRIN2BQ13224 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
GRIN2BQ13224 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
GRIN2BQ13224 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
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