Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCOCO2Q13137 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO2Q13137 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO2Q13137 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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