Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MKRN3Q13064 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKRN3Q13064 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN3Q13064 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
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