Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXF1Q12946 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXF1Q12946 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXF1Q12946 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms