Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C2orf54Q08AI8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
C2orf54Q08AI8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C2orf54Q08AI8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms