Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE4CQ08493 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4CQ08493 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4CQ08493 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms