Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF4Q08170 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF4Q08170 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms