Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGAP1Q07960 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGAP1Q07960 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP1Q07960 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGAP1Q07960 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP1Q07960 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms