Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBQ06643 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBQ06643 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBQ06643 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBQ06643 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBQ06643 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBQ06643 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBQ06643 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBQ06643 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBQ06643 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBQ06643 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBQ06643 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBQ06643 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBQ06643 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBQ06643 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBQ06643 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBQ06643 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBQ06643 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBQ06643 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBQ06643 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBQ06643 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBQ06643 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBQ06643 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBQ06643 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBQ06643 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBQ06643 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBQ06643 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBQ06643 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBQ06643 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBQ06643 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBQ06643 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBQ06643 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBQ06643 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBQ06643 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBQ06643 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBQ06643 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBQ06643 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBQ06643 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBQ06643 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBQ06643 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBQ06643 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBQ06643 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBQ06643 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBQ06643 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBQ06643 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBQ06643 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBQ06643 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBQ06643 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBQ06643 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBQ06643 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBQ06643 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBQ06643 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBQ06643 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBQ06643 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBQ06643 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBQ06643 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBQ06643 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBQ06643 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBQ06643 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBQ06643 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBQ06643 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBQ06643 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTBQ06643 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBQ06643 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTBQ06643 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBQ06643 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBQ06643 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBQ06643 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBQ06643 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTBQ06643 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBQ06643 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBQ06643 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBQ06643 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBQ06643 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBQ06643 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBQ06643 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBQ06643 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBQ06643 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBQ06643 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBQ06643 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBQ06643 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBQ06643 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBQ06643 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms