Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF11Q05519 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRSF11Q05519 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF11Q05519 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF11Q05519 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms