Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRYQ05066 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRYQ05066 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRYQ05066 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRYQ05066 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRYQ05066 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRYQ05066 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRYQ05066 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRYQ05066 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRYQ05066 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRYQ05066 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRYQ05066 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRYQ05066 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRYQ05066 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRYQ05066 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRYQ05066 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRYQ05066 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRYQ05066 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRYQ05066 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRYQ05066 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRYQ05066 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRYQ05066 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRYQ05066 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRYQ05066 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRYQ05066 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRYQ05066 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRYQ05066 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRYQ05066 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRYQ05066 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRYQ05066 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRYQ05066 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRYQ05066 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRYQ05066 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRYQ05066 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRYQ05066 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRYQ05066 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRYQ05066 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRYQ05066 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRYQ05066 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRYQ05066 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRYQ05066 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRYQ05066 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRYQ05066 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRYQ05066 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRYQ05066 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRYQ05066 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRYQ05066 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRYQ05066 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRYQ05066 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRYQ05066 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRYQ05066 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRYQ05066 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRYQ05066 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRYQ05066 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRYQ05066 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRYQ05066 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRYQ05066 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRYQ05066 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRYQ05066 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRYQ05066 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRYQ05066 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRYQ05066 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRYQ05066 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRYQ05066 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRYQ05066 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRYQ05066 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRYQ05066 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRYQ05066 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRYQ05066 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRYQ05066 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SRYQ05066 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRYQ05066 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRYQ05066 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRYQ05066 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRYQ05066 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms