Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT17Q04695 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT17Q04695 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT17Q04695 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms