Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CFHR1Q03591 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFHR1Q03591 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms