Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP27A1Q02318 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP27A1Q02318 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP27A1Q02318 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms