Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OTUD4Q01804 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD4Q01804 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD4Q01804 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms