Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFITM3Q01628 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IFITM3Q01628 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms