Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAT1AQ00266 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAT1AQ00266 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAT1AQ00266 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAT1AQ00266 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms