Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG7P83436 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COG7P83436 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG7P83436 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG7P83436 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG7P83436 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG7P83436 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG7P83436 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG7P83436 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG7P83436 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
COG7P83436 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG7P83436 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG7P83436 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG7P83436 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG7P83436 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG7P83436 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG7P83436 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG7P83436 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG7P83436 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG7P83436 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COG7P83436 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG7P83436 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG7P83436 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG7P83436 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG7P83436 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG7P83436 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG7P83436 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG7P83436 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG7P83436 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG7P83436 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG7P83436 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG7P83436 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG7P83436 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG7P83436 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG7P83436 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG7P83436 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG7P83436 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG7P83436 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG7P83436 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG7P83436 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG7P83436 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG7P83436 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG7P83436 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG7P83436 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG7P83436 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG7P83436 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG7P83436 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG7P83436 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG7P83436 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG7P83436 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG7P83436 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG7P83436 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG7P83436 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COG7P83436 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG7P83436 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG7P83436 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COG7P83436 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
COG7P83436 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
COG7P83436 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG7P83436 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG7P83436 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG7P83436 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG7P83436 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG7P83436 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG7P83436 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG7P83436 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG7P83436 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG7P83436 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG7P83436 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG7P83436 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COG7P83436 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG7P83436 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG7P83436 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG7P83436 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG7P83436 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG7P83436 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG7P83436 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG7P83436 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COG7P83436 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG7P83436 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG7P83436 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG7P83436 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG7P83436 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COG7P83436 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG7P83436 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG7P83436 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG7P83436 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG7P83436 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG7P83436 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COG7P83436 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG7P83436 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG7P83436 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG7P83436 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG7P83436 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG7P83436 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG7P83436 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG7P83436 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG7P83436 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG7P83436 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG7P83436 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms