Protein–RNA interactions for Protein: P78382

SLC35A1, CMP-sialic acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A1P78382 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35A1P78382 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35A1P78382 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35A1P78382 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms