Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HBA1P69905 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HBA1P69905 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HBA1P69905 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HBA1P69905 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HBA1P69905 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HBA1P69905 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HBA1P69905 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HBA1P69905 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HBA1P69905 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HBA1P69905 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HBA1P69905 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HBA1P69905 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HBA1P69905 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HBA1P69905 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HBA1P69905 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HBA1P69905 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HBA1P69905 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HBA1P69905 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HBA1P69905 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HBA1P69905 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HBA1P69905 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HBA1P69905 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HBA1P69905 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HBA1P69905 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HBA1P69905 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HBA1P69905 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HBA1P69905 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HBA1P69905 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HBA1P69905 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HBA1P69905 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HBA1P69905 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HBA1P69905 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HBA1P69905 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HBA1P69905 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HBA1P69905 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HBA1P69905 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HBA1P69905 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HBA1P69905 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HBA1P69905 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HBA1P69905 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HBA1P69905 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HBA1P69905 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HBA1P69905 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HBA1P69905 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HBA1P69905 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HBA1P69905 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HBA1P69905 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HBA1P69905 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HBA1P69905 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HBA1P69905 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HBA1P69905 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HBA1P69905 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HBA1P69905 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HBA1P69905 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HBA1P69905 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HBA1P69905 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HBA1P69905 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HBA1P69905 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HBA1P69905 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HBA1P69905 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HBA1P69905 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HBA1P69905 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HBA1P69905 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HBA1P69905 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HBA1P69905 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HBA1P69905 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms