Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOMO3P69849 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOMO3P69849 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.9 ms