Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL38P63173 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL38P63173 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL38P63173 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL38P63173 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL38P63173 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL38P63173 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL38P63173 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL38P63173 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL38P63173 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL38P63173 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL38P63173 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL38P63173 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL38P63173 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL38P63173 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL38P63173 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL38P63173 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL38P63173 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL38P63173 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL38P63173 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL38P63173 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL38P63173 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL38P63173 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL38P63173 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL38P63173 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL38P63173 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL38P63173 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL38P63173 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL38P63173 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL38P63173 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL38P63173 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL38P63173 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL38P63173 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL38P63173 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL38P63173 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL38P63173 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL38P63173 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL38P63173 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL38P63173 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL38P63173 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL38P63173 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL38P63173 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL38P63173 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL38P63173 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL38P63173 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL38P63173 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL38P63173 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL38P63173 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL38P63173 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL38P63173 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL38P63173 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL38P63173 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL38P63173 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL38P63173 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL38P63173 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL38P63173 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL38P63173 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL38P63173 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL38P63173 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL38P63173 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL38P63173 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL38P63173 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL38P63173 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL38P63173 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL38P63173 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL38P63173 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL38P63173 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL38P63173 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL38P63173 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL38P63173 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL38P63173 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL38P63173 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms