Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL31P62899 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL31P62899 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL31P62899 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL31P62899 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL31P62899 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL31P62899 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL31P62899 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL31P62899 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL31P62899 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL31P62899 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL31P62899 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL31P62899 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL31P62899 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL31P62899 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL31P62899 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL31P62899 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL31P62899 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL31P62899 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL31P62899 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL31P62899 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL31P62899 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL31P62899 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL31P62899 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL31P62899 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL31P62899 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL31P62899 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL31P62899 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL31P62899 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL31P62899 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL31P62899 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL31P62899 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL31P62899 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL31P62899 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL31P62899 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL31P62899 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL31P62899 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL31P62899 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL31P62899 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL31P62899 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL31P62899 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL31P62899 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL31P62899 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL31P62899 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL31P62899 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL31P62899 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL31P62899 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL31P62899 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL31P62899 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL31P62899 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL31P62899 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL31P62899 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL31P62899 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL31P62899 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL31P62899 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL31P62899 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL31P62899 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL31P62899 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL31P62899 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL31P62899 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL31P62899 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL31P62899 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL31P62899 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL31P62899 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL31P62899 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL31P62899 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL31P62899 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL31P62899 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL31P62899 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL31P62899 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL31P62899 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL31P62899 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL31P62899 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL31P62899 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL31P62899 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL31P62899 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL31P62899 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL31P62899 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL31P62899 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL31P62899 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL31P62899 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms