Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P61574 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P61574 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms