Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM258P61165 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM258P61165 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM258P61165 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM258P61165 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM258P61165 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM258P61165 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM258P61165 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM258P61165 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM258P61165 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM258P61165 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM258P61165 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM258P61165 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM258P61165 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM258P61165 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM258P61165 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM258P61165 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM258P61165 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM258P61165 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM258P61165 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM258P61165 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM258P61165 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM258P61165 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM258P61165 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM258P61165 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM258P61165 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM258P61165 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM258P61165 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM258P61165 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM258P61165 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM258P61165 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM258P61165 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMEM258P61165 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms