Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSX2P58304 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
VSX2P58304 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSX2P58304 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSX2P58304 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSX2P58304 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSX2P58304 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSX2P58304 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VSX2P58304 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSX2P58304 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSX2P58304 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSX2P58304 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSX2P58304 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSX2P58304 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSX2P58304 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSX2P58304 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSX2P58304 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSX2P58304 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSX2P58304 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSX2P58304 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VSX2P58304 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSX2P58304 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSX2P58304 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSX2P58304 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSX2P58304 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSX2P58304 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSX2P58304 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSX2P58304 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSX2P58304 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSX2P58304 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSX2P58304 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSX2P58304 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSX2P58304 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSX2P58304 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSX2P58304 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSX2P58304 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSX2P58304 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSX2P58304 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSX2P58304 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSX2P58304 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSX2P58304 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSX2P58304 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSX2P58304 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSX2P58304 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSX2P58304 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSX2P58304 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSX2P58304 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSX2P58304 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSX2P58304 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSX2P58304 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VSX2P58304 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSX2P58304 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSX2P58304 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VSX2P58304 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSX2P58304 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSX2P58304 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSX2P58304 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSX2P58304 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSX2P58304 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSX2P58304 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSX2P58304 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VSX2P58304 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSX2P58304 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSX2P58304 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSX2P58304 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSX2P58304 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSX2P58304 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSX2P58304 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSX2P58304 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSX2P58304 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VSX2P58304 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSX2P58304 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSX2P58304 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSX2P58304 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSX2P58304 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSX2P58304 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSX2P58304 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSX2P58304 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSX2P58304 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSX2P58304 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSX2P58304 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSX2P58304 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VSX2P58304 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSX2P58304 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSX2P58304 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSX2P58304 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSX2P58304 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSX2P58304 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSX2P58304 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSX2P58304 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VSX2P58304 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSX2P58304 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms