Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX16P57768 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX16P57768 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX16P57768 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX16P57768 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX16P57768 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX16P57768 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX16P57768 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX16P57768 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX16P57768 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX16P57768 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX16P57768 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX16P57768 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX16P57768 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX16P57768 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX16P57768 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX16P57768 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX16P57768 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX16P57768 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX16P57768 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX16P57768 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX16P57768 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX16P57768 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX16P57768 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX16P57768 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX16P57768 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX16P57768 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX16P57768 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX16P57768 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX16P57768 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX16P57768 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX16P57768 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX16P57768 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX16P57768 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX16P57768 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX16P57768 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX16P57768 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX16P57768 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX16P57768 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX16P57768 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX16P57768 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX16P57768 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX16P57768 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX16P57768 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX16P57768 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX16P57768 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX16P57768 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX16P57768 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX16P57768 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX16P57768 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX16P57768 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX16P57768 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX16P57768 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX16P57768 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX16P57768 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX16P57768 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX16P57768 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX16P57768 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX16P57768 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX16P57768 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX16P57768 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX16P57768 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX16P57768 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX16P57768 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX16P57768 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX16P57768 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX16P57768 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX16P57768 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX16P57768 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX16P57768 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX16P57768 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX16P57768 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX16P57768 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX16P57768 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX16P57768 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX16P57768 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX16P57768 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX16P57768 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX16P57768 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX16P57768 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX16P57768 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX16P57768 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX16P57768 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX16P57768 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX16P57768 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX16P57768 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX16P57768 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX16P57768 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX16P57768 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX16P57768 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX16P57768 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX16P57768 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms