Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN12P56749 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN12P56749 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN12P56749 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN12P56749 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN12P56749 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN12P56749 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN12P56749 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN12P56749 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN12P56749 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN12P56749 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN12P56749 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN12P56749 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN12P56749 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN12P56749 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN12P56749 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN12P56749 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN12P56749 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN12P56749 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN12P56749 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN12P56749 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN12P56749 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN12P56749 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN12P56749 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN12P56749 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN12P56749 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN12P56749 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLDN12P56749 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN12P56749 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN12P56749 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN12P56749 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN12P56749 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN12P56749 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN12P56749 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms