Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT3AP56704 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WNT3AP56704 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT3AP56704 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT3AP56704 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT3AP56704 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT3AP56704 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WNT3AP56704 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WNT3AP56704 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
WNT3AP56704 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms