Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP1P56182 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RRP1P56182 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP1P56182 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP1P56182 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP1P56182 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP1P56182 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RRP1P56182 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP1P56182 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RRP1P56182 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP1P56182 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RRP1P56182 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP1P56182 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP1P56182 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP1P56182 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP1P56182 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP1P56182 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RRP1P56182 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RRP1P56182 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RRP1P56182 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RRP1P56182 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RRP1P56182 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RRP1P56182 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RRP1P56182 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RRP1P56182 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RRP1P56182 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RRP1P56182 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RRP1P56182 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RRP1P56182 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RRP1P56182 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RRP1P56182 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RRP1P56182 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RRP1P56182 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RRP1P56182 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RRP1P56182 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RRP1P56182 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RRP1P56182 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RRP1P56182 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RRP1P56182 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RRP1P56182 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RRP1P56182 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RRP1P56182 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RRP1P56182 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
RRP1P56182 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RRP1P56182 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RRP1P56182 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RRP1P56182 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RRP1P56182 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RRP1P56182 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RRP1P56182 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RRP1P56182 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RRP1P56182 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RRP1P56182 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RRP1P56182 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RRP1P56182 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RRP1P56182 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RRP1P56182 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RRP1P56182 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RRP1P56182 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRP1P56182 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRP1P56182 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRP1P56182 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RRP1P56182 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRP1P56182 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRP1P56182 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRP1P56182 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RRP1P56182 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RRP1P56182 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRP1P56182 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RRP1P56182 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRP1P56182 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RRP1P56182 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRP1P56182 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRP1P56182 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRP1P56182 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRP1P56182 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RRP1P56182 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RRP1P56182 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP1P56182 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP1P56182 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP1P56182 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP1P56182 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP1P56182 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP1P56182 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP1P56182 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
RRP1P56182 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRP1P56182 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRP1P56182 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRP1P56182 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRP1P56182 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRP1P56182 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RRP1P56182 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRP1P56182 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RRP1P56182 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRP1P56182 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRP1P56182 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRP1P56182 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RRP1P56182 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRP1P56182 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RRP1P56182 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms