Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FCGRTP55899 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FCGRTP55899 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FCGRTP55899 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms