Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRLP54845 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRLP54845 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRLP54845 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRLP54845 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRLP54845 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRLP54845 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRLP54845 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRLP54845 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRLP54845 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRLP54845 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRLP54845 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRLP54845 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRLP54845 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRLP54845 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRLP54845 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRLP54845 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NRLP54845 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRLP54845 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRLP54845 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRLP54845 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRLP54845 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRLP54845 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRLP54845 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRLP54845 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRLP54845 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRLP54845 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRLP54845 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRLP54845 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRLP54845 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRLP54845 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NRLP54845 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRLP54845 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRLP54845 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NRLP54845 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRLP54845 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NRLP54845 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRLP54845 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRLP54845 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRLP54845 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NRLP54845 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRLP54845 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRLP54845 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRLP54845 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRLP54845 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRLP54845 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRLP54845 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRLP54845 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRLP54845 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRLP54845 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRLP54845 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRLP54845 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRLP54845 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRLP54845 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRLP54845 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRLP54845 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRLP54845 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRLP54845 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRLP54845 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRLP54845 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRLP54845 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRLP54845 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRLP54845 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRLP54845 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRLP54845 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRLP54845 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRLP54845 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NRLP54845 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NRLP54845 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRLP54845 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRLP54845 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRLP54845 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRLP54845 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRLP54845 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRLP54845 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRLP54845 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRLP54845 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NRLP54845 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRLP54845 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRLP54845 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRLP54845 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRLP54845 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRLP54845 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRLP54845 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms