Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP12AP54707 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP12AP54707 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP12AP54707 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms