Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATXN1P54253 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATXN1P54253 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms