Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIMK2P53671 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIMK2P53671 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK2P53671 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMK2P53671 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms