Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIMK1P53667 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMK1P53667 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMK1P53667 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms