Protein–RNA interactions for Protein: P52757

CHN2, Beta-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN2P52757 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN2P52757 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN2P52757 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN2P52757 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN2P52757 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN2P52757 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN2P52757 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN2P52757 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN2P52757 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN2P52757 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN2P52757 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN2P52757 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN2P52757 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN2P52757 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN2P52757 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN2P52757 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN2P52757 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN2P52757 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN2P52757 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN2P52757 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN2P52757 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN2P52757 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN2P52757 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN2P52757 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN2P52757 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN2P52757 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN2P52757 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN2P52757 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN2P52757 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN2P52757 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN2P52757 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN2P52757 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN2P52757 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN2P52757 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN2P52757 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN2P52757 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN2P52757 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN2P52757 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN2P52757 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN2P52757 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN2P52757 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN2P52757 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN2P52757 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN2P52757 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN2P52757 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN2P52757 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN2P52757 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHN2P52757 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHN2P52757 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHN2P52757 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHN2P52757 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHN2P52757 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHN2P52757 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHN2P52757 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHN2P52757 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHN2P52757 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHN2P52757 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHN2P52757 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHN2P52757 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHN2P52757 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHN2P52757 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHN2P52757 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHN2P52757 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHN2P52757 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHN2P52757 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHN2P52757 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHN2P52757 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHN2P52757 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHN2P52757 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHN2P52757 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHN2P52757 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHN2P52757 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHN2P52757 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHN2P52757 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHN2P52757 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHN2P52757 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHN2P52757 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHN2P52757 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHN2P52757 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHN2P52757 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHN2P52757 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHN2P52757 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHN2P52757 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHN2P52757 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHN2P52757 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHN2P52757 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHN2P52757 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHN2P52757 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHN2P52757 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHN2P52757 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHN2P52757 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHN2P52757 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHN2P52757 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHN2P52757 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHN2P52757 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHN2P52757 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHN2P52757 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHN2P52757 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHN2P52757 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHN2P52757 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms