Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP7P51809 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VAMP7P51809 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VAMP7P51809 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP7P51809 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms