Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BRCA2P51587 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRCA2P51587 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRCA2P51587 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms