Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
SMARCA4P51532 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC45.42■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC45.39■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
SMARCA4P51532 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
SMARCA4P51532 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
SMARCA4P51532 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC45.23■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SMARCA4P51532 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC45.19■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SMARCA4P51532 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms