Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT8P50990 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT8P50990 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT8P50990 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT8P50990 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT8P50990 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT8P50990 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT8P50990 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT8P50990 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT8P50990 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT8P50990 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT8P50990 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT8P50990 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT8P50990 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT8P50990 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT8P50990 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT8P50990 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT8P50990 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8P50990 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8P50990 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8P50990 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8P50990 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT8P50990 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8P50990 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8P50990 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8P50990 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8P50990 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8P50990 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8P50990 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT8P50990 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT8P50990 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT8P50990 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8P50990 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8P50990 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8P50990 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8P50990 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8P50990 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8P50990 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8P50990 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8P50990 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8P50990 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8P50990 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8P50990 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8P50990 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8P50990 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8P50990 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8P50990 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT8P50990 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT8P50990 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT8P50990 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT8P50990 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8P50990 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8P50990 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8P50990 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8P50990 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8P50990 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8P50990 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8P50990 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8P50990 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8P50990 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8P50990 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8P50990 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8P50990 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8P50990 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8P50990 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8P50990 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8P50990 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8P50990 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8P50990 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8P50990 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8P50990 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8P50990 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms