Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK7P50613 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK7P50613 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK7P50613 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK7P50613 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK7P50613 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK7P50613 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK7P50613 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK7P50613 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK7P50613 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK7P50613 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK7P50613 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK7P50613 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK7P50613 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK7P50613 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK7P50613 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK7P50613 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK7P50613 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK7P50613 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK7P50613 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK7P50613 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK7P50613 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK7P50613 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK7P50613 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK7P50613 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK7P50613 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK7P50613 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK7P50613 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK7P50613 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK7P50613 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK7P50613 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK7P50613 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK7P50613 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK7P50613 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK7P50613 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK7P50613 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK7P50613 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK7P50613 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK7P50613 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK7P50613 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK7P50613 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK7P50613 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK7P50613 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK7P50613 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK7P50613 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK7P50613 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK7P50613 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK7P50613 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK7P50613 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK7P50613 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK7P50613 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK7P50613 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK7P50613 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK7P50613 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK7P50613 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK7P50613 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK7P50613 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK7P50613 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK7P50613 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK7P50613 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK7P50613 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK7P50613 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK7P50613 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK7P50613 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDK7P50613 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK7P50613 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK7P50613 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK7P50613 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK7P50613 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK7P50613 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK7P50613 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK7P50613 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK7P50613 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK7P50613 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDK7P50613 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDK7P50613 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK7P50613 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK7P50613 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK7P50613 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK7P50613 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK7P50613 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK7P50613 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK7P50613 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK7P50613 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK7P50613 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK7P50613 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK7P50613 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK7P50613 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK7P50613 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK7P50613 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK7P50613 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK7P50613 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK7P50613 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK7P50613 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK7P50613 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK7P50613 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK7P50613 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK7P50613 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK7P50613 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK7P50613 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms